Con trai của một thủy thủ, Sosuke 5 tuổi sống một cuộc sống yên tĩnh trên một vách đá Oceanside với mẹ Lisa. Một ngày định mệnh, anh ta tìm thấy một con cá vàng xinh đẹp bị mắc kẹt trong một chai trên bãi biển và giải cứu cô ấy, đặt tên cho cô ấy ponyo. Nhưng cô ấy không phải là con cá vàng bình thường. Con gái của một phù thủy thành thạo và nữ thần biển, Ponyo sử dụng phép thuật của cha mình để biến mình thành một cô gái trẻ và nhanh chóng yêu Sosuke, nhưng việc sử dụng phép thuật mạnh mẽ như vậy gây ra sự mất cân bằng nguy hiểm trên thế giới. Khi mặt trăng đều đặn kéo gần Trái đất và cha của Ponyo gửi những con sóng hùng mạnh của đại dương để tìm con gái của mình, hai đứa trẻ bắt đầu một cuộc phiêu lưu của một cuộc đời để cứu thế giới và thực hiện ước mơ trở thành con người của Ponyo.